Il complesso è costituito da quattro parti distinte:
1) La chiesa di San Carlo, in stile barocco a pianta circolare con copertura a cupola, dove al suo interno, dietro l’altare maggiore, è ricostruita la camera in cui nacque san Carlo con arredi originali.
2) Tre cappelle con episodi della vita del Santo.
3) Statua colossale di San Carlo, in bronzo fuso e rame, terminata nel maggio del 1698 su progetto di G.M. Crespi detto il Cerano.
4) Il seminario, concluso nel 1643.
L’oggetto di culto conservato all’interno della chiesa sono i filamenti dei vestiti e maschera funeraria di San Carlo Borromeo.