L’interno a navata unica con sei cappelle laterali, venne decorata nel XVIII secolo.
All’altare maggiore il venerato Crocifisso ligneo del XV secolo che dà il nome al Santuario, che proveniva dall’Oratorio di S.Giovanni, situato a poca distanza dal santuario.
Nella domenica di Pentecoste ed in quella della SS. Trinità, si celebrano i festeggiamenti, con grande afflusso di gente anche dai paesi vicini a Matelica.